（一）鉴证作用
注册会计师以独立公正的第三方身份签发审计报告，对被审计单位财务报表的合法性和公允性发表审计意见，最后出具相应的审计意见。这种审计意见具有鉴证作用。
（二）保护作用
注册会计师作为独立的第三方，站在公正公允的角度上通过实施审计程序、获取审计证据，对被审计单位的财务报表在所有重大方面是否存在重大错报发表不同的审计意见。经注册会计师审计以后的财务报表，可以提高或降低财务报表使用者对财务报表的信赖程度，在一定程度上对被审计单位的财产、债权人和股东的权益及企业利害关系人的利益起到保护作用。
（三）证明作用
最终出具的审计报告，表明注册会计师已经完成了审计的相关工作。审计报告是对注册会计师审计任务完成情况及其结果所做的总结，表明审计工作的质量并明确注册会计师的审计责任。