在经济活动过程中，各种各样的会计事项会频繁发生，在这些会计事项中，有属于本期的，有跨期间的。如医院发生的收入与费用，可能存在本期付出了费用也收到了货币资金，也可能本期付出了费用未收到货币资金，还可能本期未付出费用收到了货币资金，这就形成了本期实际得到的收入可能与本期支付的费用有关，也可能与本期支付的费用无关；同样，本期支付的费用可能与本期收入有关，也可能与本期收入无关。如何把收入和费用在时间上加以配比，就出现了处理会计业务的出发点，即会计的记账基础问题。由此可见，医院会计的记账基础即会计处理时，以何种标准确认、计量、报告会计要素的基础。我国实行适度分离的双体系政府会计体系，根据《政府会计准则———基本准则》相关规定，医院会计在记账时，财务会计采用权责发生制，预算会计采用收付实现制。

权责发生制，是指以取得收取款项的权利或支付款项的义务为标志来确定本期收入和费用的会计核算基础。凡是当期已经实现的收入和已经发生的或应当负担的费用，不论款项是否收付，都应当作为当期的收入和费用；凡是不属于当期的收入和费用，即使款项已在当期收付，也不应当作为当期的收入和费用。

收付实现制，是指以现金的实际收付为标志来确定本期收入和支出的会计核算基础。凡在当期实际收到的现金收入和支出，均应作为当期的收入和支出；凡是不属于当期的现金收入和支出，均不应当作为当期的收入和支出。