尽管杜邦财务分析体系在实践中广泛运用，但仍存在一定的缺陷，主要体现在以下几方面。

其一，财务分析指标的内在不配比。杜邦分析法中的重要指标—资产净利率，为净利润与平均总资产的比值。其中，总资产是全部资产提供者享有的权利，包括股东、债权人等，而净利润是专门属于股东的，使用这两者的比值不能准确反映企业的基础盈利能力。销售净利率是净利润与营业收入的比值。其中，营业收入带来的是营业利润，而这仅是净利润的一部分，净利润还包括公允价值变动损益、资产减值损失等。因此，销售净利率不能够准确地反映企业的销售获利能力。

其二，忽视现金流信息。杜邦分析法主要采用了资产负债表和利润表的信息，但没有利用现金流量表的信息。因此，它不能够有效地反映企业的现金流状况，仅从静态的角度分析企业的经营业绩，具有一定的局限性，很容易造成信息使用者的错误决策。

其三，短期性和时效性的特点。由于杜邦分析法主要采用的指标是短期财务结果，有可能导致企业管理层过度关心短期行为，忽视企业的长远发展和长期价值创造。同样，由于财务指标主要反映过去，因此分析时对影响企业经营的新因素如无形资产等未能纳入分析体系，这也会导致企业忽视自身发展潜力和可持续发展。

因此，我们在实践中运用杜邦分析法有必要进行适当的改进。其中，包括改进财务分析体系，引入现金流量指标，让杜邦财务分析体系更加关注企业获取现金的能力。引进可持续增长率指标等，可以促使企业经营者不仅要追求净资产收益率，而且要重视与加强利润分配管理，使企业有持续增长的能力。