1.建立健全内部审计质量控制机构
进行内部审计质量控制，必须设置一个健全有效的组织机构及配备相应的专职人员。
对于规模较大，业务相对复杂的企业，应当建立结构独立的、体质完善的内部审计机构职能部门，并配备相应职能的内部审计人员团队，做到能够有效处理内部审计工作，增强对企业运营状况的监控。
若企业规模较小，审计业务量较少，则可以简化处理，设置专门的拥有相当的专业技能的内部审计质量控制人员或直接由内部审计机构负责人完成内部审计质量控制工作，总之，务必做到完善企业的内部审计质量控制机构的设置，从而能够真正有效地促进企业的发展。
2.建立健全内部审计质量控制岗位责任制
只有将内部审计质量控制的职责落实到每一个岗位和人员，才能够避免形成内部审计质量控制的真空地带，使内部审计质量控制取得良好的效果，同时使内部审计质量得到保证。健全有效的内部审计质量控制岗位责任制，能有效地提高内部审计工作质量。